В бассейне озера Тунайча сахалинский таймень распространен повсеместно, но как хищник ведет одиночный образ жизни, формируя скопления лишь на отдельных участках водоема. Весной наибольшая его концентрация наблюдается в приустьевых участках рек Комиссаровка, Подорожка, Казачка, Шпаковка, Ударница и др.
После вскрытия рек ото льда в середине апреля начинается ярко выраженный ход тайменя в реки на нерест, пик которого приходится на конец апреля – первые числа мая. Сахалинский таймень нерестится несколько раз за жизнь. Созревание сахалинских популяций тайменя наступает на 9–10-м году жизни при длине тела 90–100 см.
Нерестилища тайменя расположены обычно в среднем и верхнем течении рек. После нереста производители, как правило, сразу же скатываются в озеро, хотя известны случаи их длительной (до месяца и более) задержки в реках.
Молодь тайменя, вышедшая из нерестовых бугров, в июне – начале июля расселяется по мелководьям у песчаных и галечных кос, после того как с них произошла откочевка молоди других лососей. Начиная с годовалого возраста, населяет большие омуты или плесы с медленным течением, с заиленным песчаным или галечным дном, с нависшими и упавшими деревьями. Скат молоди из рек, впадающих в озеро, как и в других крупных водоемах Сахалина, происходит в возрасте 1+ и 2+ при достижении длины 10–25 см, начинается после прохождения пика весеннего паводка и заканчивается во время летней межени.
Сеголетки тайменя в период обитания на мелководье питаются преимущественно бентосом. Молодь тайменя длиной 10–25 см потребляет малоротую корюшку и молодь бычка, при этом бóльшую часть в их рационе составляют воздушные насекомые. Молодые таймени старшего возраста длиной до 50 см потребляют в основном массовые виды рыб (малоротые корюшки). По мере роста тайменя уменьшается потребление корюшки и увеличивается потребление сельди.
Бóльшая часть особей сахалинского тайменя в море не выходят, отдельные особи совершают зимовально-нагульные миграции река–море в течение 3–5 лет. Взрослый период жизни сахалинский таймень проводит в прибрежной зоне озера, молодь длиной 10–25 см держится близ устьев рек и проток, а крупные особи – на границе водной растительности на глубине от 5 м.
В озере Тунайча еще в 1970-е гг. добывали сахалинского тайменя массой более 30 кг. В уловах рыбаков в конце 1980-х – начале 1990-х гг. встречались особи длиной от 9,2 до 120 см и массой от 13 до 17,2 кг.
У тайменя связаны масса и длина тела. Масса тела тайменя в озере начинает резко возрастать при достижении им длины свыше 23,2 см в возрасте 3+. С этого возраста начинается освоение тайменем озера и переход на хищное питание. Приросты длины тела относительно постоянны и составляют в среднем около 8 см.
До достижения возраста 3+ прирост массы тела до 100 г в год. Начиная с четвертого года весовой прирост особей резко возрастает и равен в среднем 500 г в год. Такой равномерный прирост наблюдается до возраста 12+. После достижения этого возраста рост массы отдельных особей сильно увеличивается и достигает более 3,5 кг в год.
Рост тайменя в озере Тунайча существенно отличается от роста тайменя в других озерах юга Сахалина.
В последние десятилетия наблюдается сокращение численности большинства популяций сахалинского тайменя, что привело к занесению этого вида в Красную книгу Сахалинской области (2000) и Красную книгу Российской Федерации (2001). В то же время охрана и контроль биологического состояния популяций этого «краснокнижного» вида не налажены. Значительная часть взрослого тайменя и молоди вылавливается рыбаками-любителями.